После инцидента в научно-исследовательном комплексе "Чёрная Меза" бывший администратор Уоллес Брин после Семичасовой войны решил объявить перемирие и от лица всего человечества заключил мир с могущественной галактической организацией Альянс (он же Комбайн). В считанное время вся власть на Земле перешла в руки Альянса, председателем правительства которого стал злополучный Уоллес Брин. Все ссылки на "великолепного героя современности Гордона Фримена", уничтожившего источник нападения расы X из измерения Зен, исчезают и никто больше не может препятствовать мировому господству Альянса на Земле. Естественно многие люди переходят в оппозицию и организуют Повстанческие движения, которые успешно присекаются войсками Альянса. Проходит пятнадцать лет, многое за это время изменилось. Столицей "Нового Мира" становится один из самых крупных выживших городов - Сити-17. Здесь же располагается Цитадель - коммандно-административный центр правительства Альянса и резиденция самого Уоллеса Брина. Повстанцы вынуждены скрываться, так как их объявили вне закона и разрешили тотальное уничтожение. Альянс набрал мощность и спокойно властвует на Земле. Хотя спокойным это властвование никак не назовёшь - постоянные диверсии повстанцев не дают нормально установить мировое господство.